Правозащитный Центр "Мемориал" сообщил 20 декабря из Москвы, что власти Кыргызстана не дали обществу уйгуров Кыргызстана "Иттипак" провести 17 декабря в Бишкеке торжественное собрание, посвященное 15-й годовщине создания организации. На собрание было приглашено около 700 активистов уйгурских диаспор Кыргызстана и Казахстана, а также представители международных организаций, оно должно было состояться в помещении Кыргызского драматического театра в Бишкеке. Однако 14 декабря директор театра неожиданно сообщил председателю "Иттипак" Розмухамету Абдулбакиеву, что государственный секретарь Осмонакун Ибраимов запретил ему предоставлять помещение театра для уйгуров.

         Абдулбакиев обратился к Ибраимову и тот заявил, что причиной запрета является ноябрьское интервью Абдулбакиева газете "Агым", в котором он сообщил, что он, "как и все уйгуры", надеется, что в будущем Уйгурстан, как уйгуры называют Синьцзян-Уйгурский автономный район (СУАР) Китая, обретет независимость. По словам Ибраимова, это интервью "осложнило отношения Кыргызстана с Китаем", и пока Абдулбакиев не выступит с опровержением, собрание разрешено не будет. 15 декабря президиум "Иттипак" отверг ультиматум Ибраимова, так как "каждый уйгур рождается с мечтой о независимости родины", и отменил собрание.

         После обретения центрально-азиатскими республиками независимости вследствие распада СССР, национальные движения активизировались и в СУАР, который многие называют Восточным Туркестаном. Не в последнюю очередь для борьбы с движением уйгуров, в апреле 1996 года по инициативе Пекина в Шанхае была основана организация "Шанхайская четверка", в которую вошли имевшие общие границы Китай, Казахстан, Кыргызстан и Россия и которая в июне 2001 года, после присоединения Таджикистана и Узбекистана, была переименована в Шанхайскую организацию сотрудничества (ШОС).

         После этого в Казахстане и Кыргызстане были задержаны десятки уйгуров, которые затем, несмотря на международные пакты о невыдаче, депортировались в Китай, где их почти сразу расстреливали. В том же году Кыргызстан подписал в рамках ШОС Соглашение по борьбе с терроризмом, экстремизмом и сеператизмом (которую Пекин называет борьбой против трех зол), и положение уйгур еще более ухудшилось. 15 ноября 2003 года гонконгская газета "The Asia Times" написала, что "Китай вынудил Акаева начать репрессии против уйгуров". 13 января 2004 года уйгурская правозащитная организация "Демократия" обратилась к мировой общественности с просьбой защитить права уйгур в Кыргызстане. По сообщению организации, суд против задержанного в Кыргызстане "за хранение оружия" уйгура Джалала Кассарджи был в 1998 году сфабрикован, он был осужден к 24 годам лишения свободы и может быть выдан Китаю.

         23 мая 2003 года заместитель председателя Службы национальной безопасности Борис Полуэктов заявил на сессии парламента Кыргызстана, что два вооруженных нападения на управления внутренних дел в Джалал-Абаде 15 мая того же года, а также покушение на секретаря Совета безопасности Мисира Ашыркулова 6 сентября 2002 года могли быть организованы уйгурскими сепаратистами. Позднее по Джалал-Абадскому делу был пойман местный криминальный авторитет Адыл Каримов, а по делу Ашыркулова в настоящее время идет суд против наркомана Таалайбека Момунова. 20 июня того же года тот же Полуэктов заявил на сессии парламента, что взрыв на бишкекском рынке "Оберон" в декабре 2002 года и взрыв в обменном пункте города Ош в мае 2003 года были организованы уйгурской экстремистской организацией и Исламским движением Узбекистана, однако позднее задержаны были граждане Узбекистана Азизбек Каримов и Ильхом Изатуллаев.

         До 1950-х годов подавляющее большинство населения Восточного Туркестана составляли уйгуры, но затем Пекин начал усиленно переселять в регион ханьцев, и сейчас доля уйгурского населения сократилась почти вдвое. По официальным данным, уйгуры сейчас составляют около 46 процентов 19-миллионного населения СУАР, по данным же Андрея Гришина, опубликованным 31 мая 2004 года казахским сайтом "Навигатор-2", в СУАР всего проживает 30-32 млн человек, из них 20-22 млн - уйгуры. По официальным данным, которые могут быть занижены, в Казахстане проживает около 150 тысяч уйгуров, в Узбекистане - порядка 100 тысяч, в Кыргызстане около 50 тысяч. 18 сентября текущего года в Вашингтоне было провозглашено правительство в изгнании Восточного Туркестана, его возглавил Анвар Юсуф Турани из организации "Центр национальной свободы Восточного Туркестана".